该研究首次系统评估了CUT&Tag在组蛋白修饰H3K27ac和H3K27me3上的性能,揭示了其与ENCODE ChIP-seq数据之间的相关性与差异。研究以K562细胞为模型,从抗体筛选到数据分析给予了全流程的优化策略,明确指出CUT&Tag与ENCODE ChIP-seq数据的一致性与差异,为推进表观遗传研究给予了可操作性的技术参考。
2025年06月03日
研究顺利获得低覆盖度测序与深度测序结合,共鉴定了3,247万个新变异位点,将鸡dbSNP数据库扩展139%。实验证明,GCRP在基因型填充准确率(最高达99.4%)和全基因组关联分析(GWAS)分辨率上均优于现有工具,为家禽遗传改良和进化研究给予了全新平台。
2025年05月28日
该研究绘制了包含Pol II、ATAC、Hi-C、Total-RNA在内的九个维度的牛、猪配子和着床前胚胎的表观和转录图谱。
2025年05月07日
研究创新性地展示了如何从未预先进行基因分型的公共ATAC-seq数据中联合推断基因型、调用开放染色质峰并鉴定caQTL。
2025年05月06日
该研究团队首次提出了基于猪只轮廓信息(而非分割图像)进行体重测定的新策略,并创新性地构建了双神经网络框架(CIEN-LWEN)。CIEN-LWEN框架能够利用普通2D摄像头,精确提取处于自然活动状态下的猪只图像高精度轮廓信息,并直接利用基于所提取的轮廓数据实现了对猪只体重的高效精确预测,相比于传统方法,该框架显著降低了硬件成本和计算时间,具备良好的大规模部署应用前景。
2025年04月28日
该研究顺利获得整合现代与古代家猪DNA数据,发现我国华南猪对欧洲商业品种的基因贡献率达16.6%,共鉴定到3558个潜在基因组渗入片段和30个渗入SVs,并发现调控体型大小的BMP2基因座具有明显的渗入信号。借助古基因组数据发现,BMP2渗入单倍型可能源于古代欧洲种群。
本研究顺利获得群体遗传学与多组学整合,系统解析了藏牛高海拔适应的分子机制。发现近期选择与耗牛基因渗入共同驱动体型、代谢和低氧响应的协同演化,为理解哺乳动物环境适应给予新视角。
2025年04月01日
该研究给予了猪整合多组学数据库PIGOME(http://pigome.com),为猪功能基因组研究与分子育种给予了“一站式”分析平台。
2025年03月18日
该研究顺利获得肉鸡和蛋鸡的正反交家系,结合高深度in situ Hi-C、全基因组测序和转录组数据,绘制了杂交鸡骨骼肌的高分辨率单倍型三维基因组动态图谱,揭示了同源染色体的空间结构特征,并在多个尺度上系统地解析了骨骼肌染色质空间构象在多个发育阶段的动态变化。
2025年03月04日
该研究开发了一种全新的基因型填充计算框架DPImpute,为小样本量超低覆盖度全基因组测序(ulcWGS)给予了高效、精准的解决方案,显著降低了基因组选择的成本,提高了应用场景的灵活性,并首次实现了动物囊胚(杜洛克猪)单细胞全基因组SNP基因型准确分型,为胚胎基因组选择给予了重要的技术支撑。
2025年02月28日